Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPINA1P01009 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms