Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms