Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ERVV-2B6SEH9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-2B6SEH9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms