Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms