Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms