Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL13Q9P2N7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms