Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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COMMD9Q9P000 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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COMMD9Q9P000 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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COMMD9Q9P000 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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COMMD9Q9P000 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COMMD9Q9P000 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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