Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG68

TTL, Tubulin--tyrosine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLQ8NG68 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLQ8NG68 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLQ8NG68 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TTLQ8NG68 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLQ8NG68 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms