Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN22Q8N7P3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN22Q8N7P3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN22Q8N7P3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN22Q8N7P3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN22Q8N7P3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN22Q8N7P3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN22Q8N7P3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN22Q8N7P3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN22Q8N7P3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 376.6 ms