Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDCL2Q8N4E4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDCL2Q8N4E4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms