Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDSS1Q5T2R2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms