Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACER2Q5QJU3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms