Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms