Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL12Q53G59 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms