Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRCAPQ14761 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms