Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA4AP68366 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms