Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AP3M2P53677 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3M2P53677 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms