Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PSMB2P49721 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms