Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XCR1P46094 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
XCR1P46094 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
XCR1P46094 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
XCR1P46094 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms