Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms