Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP6V1E1P36543 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms