Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DESP17661 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DESP17661 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DESP17661 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DESP17661 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DESP17661 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms