Protein–RNA interactions for Protein: P10145

CXCL8, Interleukin-8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL8P10145 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CXCL8P10145 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL8P10145 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms