Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCER2I3L3R5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCER2I3L3R5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms