Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EME2A4GXA9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms