Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS3Q9UNS2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
COPS3Q9UNS2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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