Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK4Q9UBT3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms