Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms