Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOPXQ9BPY8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOPXQ9BPY8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms