Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms