Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms