Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms