Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HMBOX1Q6NT76 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms