Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ISXQ2M1V0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ISXQ2M1V0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms