Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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CHD4Q14839 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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CHD4Q14839 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CHD4Q14839 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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CHD4Q14839 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHD4Q14839 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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CHD4Q14839 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHD4Q14839 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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