Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TOP3AQ13472 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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