Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XRCC4Q13426 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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