Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC173Q0VFZ6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms