Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTG2P63267 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTG2P63267 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms