Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTA2P62736 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA2P62736 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms