Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms