Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GJC1P36383 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GJC1P36383 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GJC1P36383 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GJC1P36383 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms