Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATF3P18847 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATF3P18847 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATF3P18847 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATF3P18847 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF3P18847 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms