Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPI1P17947 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms