Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX4I1P13073 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms