Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOA1P02647 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms