Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAI2Q9Y5P3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAI2Q9Y5P3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAI2Q9Y5P3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAI2Q9Y5P3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms