Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NRXN3Q9Y4C0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRXN3Q9Y4C0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NRXN3Q9Y4C0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms