Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP3Q9Y446 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PKP3Q9Y446 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PKP3Q9Y446 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP3Q9Y446 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms