Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q9Y3F1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Q9Y3F1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms